مسعود پزشکیان در حکمی محمدجعفر قائم‌پناه را به عنوان معاون اجرایی خود و سرپرست نهاد ریاست‌جمهوری منصوب کرده است. قائم‌پناه یکی از اعضای شورای راهبری دفتر پزشکیان برای انتخاب اعضای کارگروه‌های پنجگانه (سیاسی، فرهنگی، اجتماعی، زیربنایی و اجرایی) و انتخاب گزینه‌های تصدی وزارتخانه‌های دولت پزشکیان بود. قائم‌پناه در دوران وزارت پزشکیان، به عنوان معاون توسعه و مدیریت منابع وزارت بهداشت خدمت کرده است. علاوه بر این، ریاست اولین دوره شورای شهر کرمانشاه، معاون درمان دانشگاه علوم پزشکی کرمانشاه، عضویت در انجمن اسلامی و مسئول اعزام دانشجویی به جبهه‌های جنگ تحمیلی در دانشگاه علوم پزشکی تبریز از جمله سوابق قائم پناه است. قائم پناه در سال ۱۴۰۱ به استفاده از سلاح‌های ساچمه‌ای علیه معترضان که منجر به تخلیه چشم‌شان شده بود، اعتراض کرد. با انتصاب او به عنوان معاون امور اجرایی رئیس‌جمهور، این ویدئو از او مجدداً در شبکه‌های اجتماعی در حال بازنشر است.